Das Programmgebiet umfasst das österreichisch-tschechische Grenzgebiet. Auf der tschechischen Seite sind das die Bezirke Südböhmen, Südmähren und Vysočina; in Österreich sind es Weinviertel, Waldviertel, Mühlviertel, Wiener Umland Nord und die Stadt Wien.

In den angrenzenden Gebieten Linz-Wels, Innviertel a Steyr-Kirchdorf in Oberösterreich und St. Pölten und Mostviertel-Eisenwurzen in Niederösterreich ist die Möglichkeit Fördermittel auszugeben auf 20% der Gesamtprogrammmittel beschränkt (sog. benachbarte Regionen).